管微波設備在食品殺菌保鮮方面具有重要用途，但該行業(yè)也存在不少問題，影響了行業(yè)的健康發(fā)展，這些問題包括——

　　
　　1.部分微波設備企業(yè)的制造技術不成熟。有些企業(yè)由于技術不過關，制造出的微波設備發(fā)生泄漏問題，既起不到對食品殺菌保鮮的作用，還會對操作工人的身體健康產生危害。
　　
　　2.部分微波設備企業(yè)夸大宣傳。有些微波設備企業(yè)對客戶（食品生產企業(yè)）宣稱，只要采用了微波處理食品，就可達到殺菌保鮮的效果，有的把微波設備說成是 “包治百病”的工具。而事實情況并非如此，不少食品企業(yè)使用微波設備后，并沒有獲得預期的微波殺菌設備保鮮效果，原因是這些微波設備廠沒有根據(jù)不同食品的特性，向客戶提供相應的微波殺菌工藝。因為不同食品所需的殺菌工藝并不相同，且有些食品并不適合使用微波設備殺菌保鮮，如紅棗等含糖量很高的食品就不宜采用微波處理，否則會被燒煳。
　　
　　3.不能為客戶量身定做微波設備。對食品殺菌保鮮和干燥而言，微波設備應該是一種非標設備，對于不同的食品，微波設備應在微波功率、磁控管排布等方面做不同的設計。殺菌時間的設定也很重要，利用微波對同樣的食品分別處理2分鐘和3分鐘，殺菌效果可能相差很大，有時會相差數(shù)倍。但有些微波設備廠由于自身的技術水平不高或嫌麻煩，不愿意根據(jù)客戶所產食品的實際情況來設計、制造微波設備，而是提前根據(jù)自己的設想做好一批相同的微波設備，然后對不同的客戶都稱“其微波設備可保證對不同的食品起到良好的殺菌保鮮和干燥效果”。
　　
　　4.據(jù)微波設備工作人員介紹，目前，全國制造微波設備的工廠有100多家。他不無擔憂地告訴記者，大量沒有針對性的微波設備投放市場，由于不能有效地對食品進行殺菌保鮮、干燥，結果是食品生產企業(yè)棄用這些微波設備，既浪費了資源，又給食品企業(yè)造成了損失，后果是越來越多的食品企業(yè)認為“微波不適合在食品工業(yè)中使用”，導致食品企業(yè)不相信微波的作用，將不利于微波設備行業(yè)的持續(xù)發(fā)展。
　　
　　5.利用新概念誤導客戶。有些微波設備廠推出了“微波+紫外線”設備，聲稱可利用微波和紫外線對食品進行雙重殺菌。其實，這是一種概念的炒作和對食品企業(yè)的誤導，因為，利用微波對食品進行處理的時間很短，只有幾分鐘，微波發(fā)射管和紫外線發(fā)射管不可能放在同一個腔體內；且紫外線的穿透力弱、短時間照射的殺菌效果并不理想，殺菌的有效距離也很短。
　　
　　缺乏配套的應用技術服務。一些微波設備廠家缺乏食品工藝、食品微生物、食品原配料等方面的知識和技術人才，不能系統(tǒng)分析食品質量問題發(fā)生的原因，不能設計出具有針對性的微波設備及合理的殺菌工藝。食品企業(yè)使用這樣的微波設備，自然不能獲得理想的效果。